Zgrada će se nalaziti na obali tjesnaca Øresund, okružena umjetnim rezervoarima. U svom smislu podsjeća na vrtlog, koji nije samo formalni uređaj, već nosi i funkcionalno opterećenje - u svakom od „krakova“bit će odvojeno izložbeno područje posvećeno jednom od oceana. Ako se u budućnosti akvarij odluči proširiti, tada se bilo koje od ovih tijela može produljiti uz minimalne troškove; tijekom procesa gradnje muzej će moći funkcionirati kao i obično.
U središtu zgrade nalazi se „Okrugla soba“, gdje se otvaraju sve glavne prostorije, uključujući predvorje čiji su podovi prozirno dno bazena.